ちょっと今開いてるPDFのページ順を逆にしたかったので、AppleScript+AcrobatのJavaScriptでこんな感じに。（実際にはKeyboardMaestroで呼び出して使ってます）

tell application "Adobe Acrobat"
do script "for (i = this.numPages - 1; i >= 0; i--) this.movePage(i);"
end tell

ま、SDKのサンプルのまんまなんですけどw

あと、両面スキャンしたウラ面が不要だったので、それをまとめて削除するヤツ。

tell application "Adobe Acrobat"
do script "for (i = this.numPages - 1; i >= 0; i--) if((i % 2)!=0) this.deletePages(i);"
end tell